Към настоящия момент Центърът за съвременна микроскопия включва следната апаратура:

  1. Andor Revolution XD спининг диск конфокален микроскопска система с висока времева резолюция за изследване на живи клетки, снабдена с апаратура за FRAP и лазерно микрооблъчване която включва:
    1. Nikon TiE инвертен микроскоп със система за автофокус
    2. Yokogawa CSU-X1 спининг диск
    3. Предметна масичка, автоматизирана в X, Y и Z посока. Движението в Z посока се осъществява чрез пиезо елемент
    4. Tри броя твърдотелни (solid state) лазери с дължини на вълните съответно 405 nm, 488 nm и 560
    5. FRAPPA Модул за флуоресцентно възстановяване след фотогасене (fluorescence recovery after photobleaching, FRAP) и фотоактивация (photoactivation, PA)
    6. TuCam модул който позволява едновременно регистриране на образи в две различни дължини на вълните
    7. Две iXon3 EMCCD Камери с електронно усилване на сигнала
    8. Borealis
    9. Оптична антивибрационна маса
    10. Компютърна конфигурация за управление на микроскопската система
    11. Клетъчен инкубатор за микроскоп
    12. CO2 контролер за поддържане на концентрацията на CO в клетъчния инкубатор
    13. Tемпературен контролер и за поддържане на подходяща температура в клетъчния инкубатор
    14. Micropoint лазерен микроирадиационен модул
    15. IQ компютърна програма за управление на компонентите на микроскопската система, спининг диска, микроирадиационния модул и FRAP модул
    16. MetaMorph компютърна програма за управление на компонентите на микроскопската система и за анализ на изображения
  2. Zeiss Axiovert 200M инвертен моторизиран епифлуресцентен микроскоп които включва:
    1. Axiovert 200M инвертен моторизиран епифлуресцентен микроскоп
    2. Апотом
    3. Аxiocam камера
    4. антивибрационна маса
    5. Axiovision компютърна програма (софтуер) за управление на компонентите на микроскопската система и за анализ на изображения
  3. Andor Dragonfly 505 микроскопска система за:
    1. Multi-Point конфокална микроскопия, Widefield микроскопия, TIRF микроскопия
    2. ClearView-GPU деконволюция, SRRF-Stream суперзаделителна микроскопия, dSTORM суперзаделителна микроскопия
    3. Andor Mosaic 3 Duet за FRAP и фотоактивация
    4. Andor MicroPoint Galvo – Лазерна микроирадиация
    5. Andor ILE-400 Интегриран лазерен комбайнер
    6. 405 nm, 488 nm, 561 nm, 637 nm лазери
    7. Okolab Bold Line Cage CO2 инкубатор
    8. Инвертен Микроскоп Nikon ECLIPSE Ti2-E
    9. Perfect Focus 4 cистема за автофокус
    10. Andor iXon Ultra 888 EMCCD камера
    11. Andor Zyla 4.2 Plus sCMOS камера
    12. CoolLED pE300 епифлуресценция за DAPI, GFP, RFP
    13. CoolLED pE100
    14. Fusion софтуерен пакет
    15. IQ3 софтуерен пакет
  4. STELLARIS 8 STED микроскоп
    1. Сканираща конфокална микроскопия
    2. Бял лазер (излъчване от 440 до 790 нм
    3. Предметна масичка, автоматизирана в X, Y и Z посока. Движението в Z посока се осъществява чрез пиезо елемент
    4. Power HyD S, HyD X, и HyD R детектори
    5. Супер-рaзделителена микроскопия на базата на стимулирано потискане на емисиите (STED)
    6. Микроскопия за заснемане на флуоресцентната преживяемост (FLIM)
    7. Супер-рaзделителна микроскопия на базата на стимулирано потискане на емисиите (STED) с FLIM анализ (TauSTED)
    8. Флуресцентна корелационна спектроскопия (FSC)
    9. Микроскопия на базата на флуресцентен резонансен енергиен трансфер (FRET)
    10. Lightning (адаптивна деконволюция)
    11. FRAP
    12. Оптична антивибрационна маса
    13. Компютърна конфигурация за управление на микроскопската система
    14. Клетъчен инкубатор за микроскоп
    15. Kонтролер за поддържане на концентрацията на CO2 и О2 в клетъчния инкубатор
    16. Температурен контролер и за поддържане на подходяща температура в клетъчния инкубатор
    17. Leica Application Suite X (LAS X) софтуер
  5. ZEISS LSM 980 with Airyscan 2
    1. Сканираща конфокална микроскопия
    2. 36 канален (GASP) детектор
    3. Лазерна система с 405, 488, 561 и 594 нм облъчване
    4. Предметна масичка, автоматизирана в X, Y и Z посока. Движението в Z посока се осъществява чрез пиезо елемент
    5. Airyscan супер-резолюция
    6. FRAP
    7. UV микрооблъчване
    8. Оптична антивибрационна маса
    9. Компютърна конфигурация за управление на микроскопската система
    10. Клетъчен инкубатор за микроскоп
    11. Kонтролер за поддържане на концентрацията на CO2 и О2 в клетъчния инкубатор
    12. Температурен контролер за поддържане на подходяща температура в клетъчния инкубатор
    13. Zen blue софтуер
  6. PicoQuant FLIM for ZEISS LSM 980
    1. Rapid FLIM HiRes
    2. 488 и 561 нм. Пулсови лазери
    3. PMA Хибриден детектор SPAD (single photon avalanche diode) детектор
    4. TCSPC Електроника (MultiHarp 150)
    5. Пулсово синхронизирано излъчване (PIE)
    6. Флуресцентна Анизитропия (Pоляризация)
    7. Флуресцентна Корелационна Микроскопия (FCS)
    8. Микроскопия на базата на флуресцентен резонансен енергиен трансфер (FRET)
    9. SymPhoTime 64 софтуер
  7. ZEISS SteREO Discovery.V20 микроскоп
  8. Компютърни програми за анализ на микроскопски изображения:
    1. Imaris
    2. CellTool
    3. ImageJ
    4. Fiji